A Direção Acadêmica é o órgão executivo que superintende e coordena as atividades fim da SOBERANA, sendo o setor responsável por todas as decisões referentes ao âmbito acadêmico da SOBERANA Faculdade de Saúde. Cabe a Direção Acadêmica, assessorada pela Secretaria Geral, no exercício de suas atribuições, gerir as atividades acadêmicas de acordo com as estratégias, políticas, objetivos, diretrizes e metas institucionais definidas pela Direção Geral.